在探讨硒与疾病健康的关系时，微量元素检测仪厂家认为硒对机体免疫系统的影响是不容忽视的一个方面，而且由于免疫系统是机体抗癌机制的重要组成部分，而显得更为重要。硒能有效地提高机体免疫水平已为较多的研究所证实，其作用涉及体液免疫和细胞免疫两个方面。
在体液免疫方面，研究表明，给动物补硒能提高对羊红细胞抗原或破伤风类毒素的抗体滴定度，包括较高水平的免疫球蛋白M (IgM)和免疫球蛩白G(IgG);反之，当动物缺硒时，体液免疫反应降低，包括抗体滴定度降低和免疫反应时间延迟。此外，硒还能抵消免疫抑制剂（如甲基汞）引起的免疫抑制。
在细胞免疫方面，国外研究者观察到，补硒动物对致敏剂的敏感性高于对照组，而且能缩短皮肤同种异体排斥时间；缺硒动物巨噬细胞减少，降低巨噬细胞与中性粒细胞杀灭能力，甚至影响其后代的免疫能力。
在细胞免疫体系中，中性粒细胞(PMN)具有趋化、吞噬和杀菌功能，而且能产生活性氧化代谢产物( ROS)，直接杀伤肿瘤细胞而为免疫研究者所关注。
对低硒克山病和大骨节病病区居民红细胞免疫功能与硒水平关系的研究亦发现，低硒人体红细胞C3b受体花环率明显低下，而血清红细胞免疫抑制率明显增高，免疫复合花环率无改变，血硒水平与红细胞C3b受体花环率呈明显正相关；补硒后在血硒水平上升的同时，红细胞C3b受体花环率也明显增高。这说明低硒人体红细胞免疫功能低下，补硒可恢复低硒人体红细胞免疫功能的失调。
近来，在硒与免疫关系研究中出现了一个新课题—硒与艾滋病。艾滋病即获得性免疫缺陷综合征，患者由于免疫功能低下，可患多种疾病而致死，其中念珠菌感染亦常见。由于观察到缺硒动物易患口腔念珠菌病，人们开始考虑硒与艾滋病的关系。美国Dworkin等就此进行了初步研究，通过测定13例艾滋病患者，8倒ARC患者和14名健康人的全血、血浆和红细胞硒含量及GSH-Px活性，发现艾滋病病人处于低硒状态。其中，艾滋病组GSH-Px活性以及全血、血浆和红细胞硒含量均显著低于对照组，而艾滋病与ARC组之间无显著差异。体内硒的损耗是艾滋病患者一种常见的恶性特征，因而低硒可认为是艾滋病发展的结果；但亦有人认为低硒可能是发病因素之一。由于艾滋病和硒都与机体免疫功能有关，硒与艾滋病的关系是一个值得深入研究的课题。
